Molekel ist ein interaktives, dreidimensionales Molekülgrafik-Paket. Man kann es sich kostenlos von der Site http://www.cscs.ch/molekel/ herunterladen.
Nachdem man das Programm installiert hat, kopiert man die GAMESS-Outputfiles in das gleiche Verzeichnis wie Molekel.
Startet man dann Molekel, erhält man folgendes Fenster:
Ein rechter Mausklick auf dieses Fenster führt zu einem Popup-Menü, darin geht man auf "Load". Es öffnet sich ein weiteres Popup-Menü, in dem man auf "gamess (us) log" klickt. Es erscheint dann das folgende Menü:
In diesem Menü wählt man den interessierenden File aus und klickt auf "Accept". Dann wird im Hauptfenster die Geometrie des Moleküls dargestellt:
Man kann auch andere Darstellungsoptionen auswählen (z. B. ball & sticks):
Ein rechter Mausklick auf das molekel main window öffnet wieder das Popup-Menü, indem man dann weitere Optionen auswählen kann. Z. B. Compute -> Orbital; man erhält dann ein Fenster, in dem die Orbitalenergien aufgelistet sind. Aus diesen kann man dann das gewünschte Orbital auswählen
Man erhält dann eine Darstellung des MO's, die man in vielfältiger Weise modifizieren kann.
Das MO-Bild kann man in unterschiedlichen Formaten abspeichern und dann mit anderen Grafikprogrammen (z. B. Paintshop) weiterverarbeiten.